हालांकि उनकी कार्यशैली पर भी सवाल उठते रहे हैं. पार्टी में भी उन पर सवाल उठते रहे और केंद्रीय नेतृत्व की ओर से उनको मिलने वाली तवज्जो के कारण कई पुराने नेताओं में उनके ख़िलाफ़ नाराज़गी भी बढ़ी.

लेकिन कहा जाता है कि कामयाबी अपने पीछे तमाम अवगुणों को छिपा लेती है. बीते पांच वर्षो के दौरान केंद्रीय नेतृत्व ने भी उनको लगातार तवज्जो दी और बंगाल से संबंधित पार्टी के नीतिगत फैसलों में उनकी राय अहम रही.

शुभेंदु ने वर्ष 2006 के विधानसभा में पहली बार कांथी दक्षिण सीट से तृणमूल कांग्रेस के टिकट पर चुनाव जीता था.

उसके बाद वर्ष 2009 में उन्होंने तमलुक सीट से लोकसभा का चुनाव लड़ा और जीते. 2014 के चुनावों में भी उन्होंने अपनी सीट पर क़ब्ज़ा बनाए रखा.

उसके बाद वर्ष 2016 के विधानसभा चुनावों में उन्होंने नंदीग्राम सीट से चुनाव जीता और ममता मंत्रिमंडल में परिवहन मंत्री बनाए गए. धीरे-धीरे उनको सरकार में नंबर दो माना जाने लगा था.

उनके राजनीतिक करियर की शुरुआत तो छात्र राजनीति से उसी समय हो गई थी जब वो कांथी स्थित पीके कॉलेज से ग्रेजुएशन की पढ़ाई कर रहे थे.

वर्ष 1989 में वो कांग्रेस के छात्र संगठन छात्र परिषद के प्रतिनिधि चुने गए थे. शुभेंदु 36 साल की उम्र में पहली बार 2006 में कांथी दक्षिण सीट से विधायक चुने गए.

इसके बाद उसी साल उनको कांथी नगरपालिका का अध्यक्ष नियुक्त किया गया. शुभेंदु वर्ष 2009 और 2014 में तमलुक लोकसभा सीट से चुनाव जीते थे.

लेकिन वर्ष 2016 में ममता ने उनको नंदीग्राम सीट से मैदान में उतारा और वो आसानी से जीत गए. शुभेंदु का राजनीतिक करियर भले ही 1990 के दशक में शुरू हुआ हो. लेकिन वर्ष 2007 में नंदीग्राम के अधिग्रहण विरोधी आंदोलन ने एक कद्दावर नेता के तौर पर उनकी पहचान स्थापित की.

लो प्रोफाइल सांसद रहे शुभेंदु अपनी सांगठनिक कौशल के कारण आगे चलकर बहुत कम समय में तृणमूल कांग्रेस में सत्ता का वैकल्पिक केंद्र बन गए.

पूर्व मेदिनीपुर ज़िले को अधिकारी परिवार का गढ़ माना जाता है. शुभेंदु के पिता और भाई भी तृणमूल कांग्रेस के टिकट पर लोकसभा और विधानसभा चुनाव जीतते रहे हैं.

राजनीतिक विश्लेषकों का कहना है कि तृणमूल कांग्रेस को सत्ता तक पहुंचाने में जिस नंदीग्राम आंदोलन में अहम भूमिका निभाई थी उसके मुख्य आर्किटेक्ट शुभेंदु ही थे.

वर्ष 2007 में कांथी दक्षिण सीट से विधायक होने के नाते तत्कालीन वाममोर्चा सरकार के ख़िलाफ़ भूमि उच्छेद प्रतिरोध कमिटी के बैनर तले स्थानीय लोगों को एकजुट करने में उनकी भूमिका सबसे अहम रही थी.

तब नंदीग्राम में प्रस्तावित केमिकल हब के लिए ज़मीन अधिग्रहण के ख़िलाफ़ आंदोलन की सुगबुगाहट शुरू ही हुई थी. उस दौर में इलाके में हल्दिया के सीपीएम नेता लक्ष्मण सेठ की तूती बोलती थी.

लेकिन यह शुभेंदु ही थे जिनके कारण से इलाक़े के सबसे ताक़तवर नेता रहे सेठ को हार का सामना करना पड़ा था.